Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCGF6Q9BYE7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms