Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms