Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
C2orf88Q9BSF0 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms