Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms