Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms