Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRIQ1Q96JM4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms