Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIC2Q96JB3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms