Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LTV1Q96GA3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LTV1Q96GA3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms