Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGF29Q96ES7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SGF29Q96ES7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGF29Q96ES7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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SGF29Q96ES7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SGF29Q96ES7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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