Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAF2Q96CS3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms