Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMARCE1Q969G3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms