Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRG4Q92954 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG4Q92954 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms