Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM41Q8WV44 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM41Q8WV44 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms