Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF248Q8NDW4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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ZNF248Q8NDW4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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ZNF248Q8NDW4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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ZNF248Q8NDW4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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ZNF248Q8NDW4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF248Q8NDW4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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