Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TSSK4Q6SA08 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TSSK4Q6SA08 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms