Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ANKRD54Q6NXT1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms