Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LGSNQ5TDP6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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