Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WDR44Q5JSH3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WDR44Q5JSH3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms