Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms