Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
KLHL12Q53G59 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
KLHL12Q53G59 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms