Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPHKAPQ2M3C7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPHKAPQ2M3C7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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