Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC142Q17RM4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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