Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRNQ16849 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRNQ16849 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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