Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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HIF1AQ16665 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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