Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDK4Q16654 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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