Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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RPE65Q16518 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPE65Q16518 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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