Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNGA3Q16281 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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CNGA3Q16281 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNGA3Q16281 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms