Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHRNA2Q15822 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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