Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALX1Q15699 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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