Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SS18Q15532 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
SS18Q15532 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms