Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms