Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CTTNQ14247 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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