Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms