Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HTR4Q13639 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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