Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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IFT88Q13099 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFT88Q13099 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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