Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRDM2Q13029 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
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