Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GRIK3Q13003 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms