Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTP4A2Q12974 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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