Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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PTPRJQ12913 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRJQ12913 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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