Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COX10Q12887 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms