Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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KCNMA1Q12791 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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KCNMA1Q12791 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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KCNMA1Q12791 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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KCNMA1Q12791 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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KCNMA1Q12791 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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KCNMA1Q12791 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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KCNMA1Q12791 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNMA1Q12791 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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