Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RBBP4Q09028 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RBBP4Q09028 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms