Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC6Q03468 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC6Q03468 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms