Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SH3BP2P78314 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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