Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms