Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SNAP25P60880 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAP25P60880 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms