Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCCD1P59942 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCCD1P59942 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms