Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NME5P56597 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NME5P56597 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME5P56597 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms