Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BRCA2P51587 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms