Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCA2P51531 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA2P51531 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms